ホーム › ドキュメント › 応用例 › 癌免疫療法研究の応用例

癌免疫療法研究の応用例

83 genes of the single-cell gene-expression profiles were divided to 2 different groups by the principle component analysis (PCA). Genes that positively contributed to inclusion of single cells in each group were identified by the PC1 loading value and then performed a Gene Ontology (GO) enrichment analysis theme. The 2 groups were found to be enriched for divers GO terms and revealed that the existence of 2 different states, “activated” and “quiescent”.免疫療法の研究で，著者らは，白血病または固形癌に対するウィルスムス腫瘍遺伝子1(WT1)ワクチンに対するレスポンダーとノンレスポンダーの違いを調べようとしました。クラスタリング及び主成分分析(PCA)は，WT1ワクチン接種前にレスポンダーと非レスポンダーを区別できませんでしたが，これらの分析により，WT1特異的細胞傷害性Tリンパ球(CTL)のエフェクタメモリ(EM)サブセットは，”活性化”状態と”静止”状態の2つのグループに分類できることが明らかになりました。更に，WT1ワクチン接種後に，CTLのEMサブセットが，レスポンダーでは”静止”状態に，非レスポンダーでは”活性化”状態に移行しました。この発見により，将来の先進的遺伝子発現プロファイル分析を使用して，WT1ワクチン接種前にレスポンダーと非レスポンダーを明確に区別する手がかりを得られるかもしれません。

参考文献：

  • Nakae Y, et al. (2015) Two distinct effector memory cell populations of WT1 (Wilms’ tumor gene 1)-specific cytotoxic T lymphocytes in acute myeloid leukemia patients. Cancer Immunol Immunother. 64(7):791-804. [PubMed:25835542]
Top