プロテアソーム活性化因子PA28γは，コア変質を調節し，HCVの病因に重要な役割を果たしているため，抗HCV療法の有望な標的です。肝臓でコアを発現するトランスジェニックマウスでのPA28γ発現の抑制は，HCVの病因を損ないます。 ただし，HCVの病因におけるPA28γの役割の正確な理解は不明なままです。生物学的ネットワークに関与するPA28γの役割を研究するために，野生型(WT)サンプルに対してPA28γ発現ノックアウト，または非ノックアウトCoreトランスジェニックマウスを比較することにより，差次的に発現される遺伝子をタンパク質アレイを使用して同定した。次に，TargetMineを使用して拡張PPIネットワークを確立するために，差次的に発現したタンパク質をヒトPPIと統合しました。TargetMineは，HCV病態におけるコアとPA28γの標的となる細胞プロセスを同定するための推定PPIネットワークの機能分析にも採用され，HCV感染における潜在的な役割のさらなる実験的調査のための候補に優先順位を付けました。
参考文献：
- Tripathi LP, et al. (2012) Proteomic Analysis of Hepatitis C Virus (HCV) Core Protein Transfection and Host Regulator PA28γ Knockout in HCV Pathogenesis: A Network-Based Study. J Proteome Res. 11: 3664-3679. [PubMed:22646850]
